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Protocolos

 
Digestión de
Geles Teñidos con Plata
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1. CORTE DE LAS MANCHAS
Cortar las bandas o manchas con una hoja de bisturí o con una punta de pipeta recortada y depositar cada una en un pocillo de una placa de 96 pocillos o en tubos eppendorf.


2. LAVADO
Realizar 2 lavados con agua mili-Q durante 10 min.

 

3. DESTEÑIDO
Cubrir las bandas con la solución de desteñido e incubar 10 min.
Solución de desteñido: 30 mM de ferrocianuro potásico (9.9 mg/ml) y 100 mM de tiosulfato sódico (24.8 mg/ml).


4. LAVADO
Con agua milli-Q para retirar la solución de desteñido.


5. DESHIDRATACIÓN
Añadir acetonitrilo (AcN) hasta que cubra la banda o mancha (20 ml) y esperar 5 min para que el gel se deshidrate y libere el colorante. Repetir esta operación dos veces para que el gel quede más o menos blanco.


6. SECAR A VACÍO EN CENTRÍFUGA "SPEED-VAC"

 

7. REDUCCIÓN Y ALQUILACIÓN
1. Cubrir las bandas con una solución 10 mM Di-tio-treitol (DTT) en bicarbonato amónico 25 mM (NH4HCO3 ), 30 min a 56°C.
2. Dejar a temperatura ambiente, eliminar el DTT y añadir AcN que se retira rápidamente para incubar con Iodoacetamida 55mM (10 mg /ml) en 25 mM NH4HCO3 durante 15 min en oscuridad.

 

 

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Centro de Genómica y Proteómica
Unidad de Proteómica
Facultad de Farmacia - UCM - Pza Ramón y Cajal s/n
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